一、食品工廠設計之污水處理的活性污泥法
當水中有充足的溶解氧和有機物時，微生物就會大量地繁殖。微生物從水中吸收有機物，加速活動和繁殖，形成生物高度活動的中心，這個凝聚著無數各種各樣的微生物的中心稱作生物絮體，俗稱生物泥粒，又稱活性污泥。這個有氧氣、有養料的無數微生物活動凝聚的中心對有機物具有很強的吸附與氧化分解能力，因此，用它來凈化食品工廠的污水，即活性污泥法。
活性污泥法的形式有多種，但大都有共同特征。需要進行活性污泥處理的食品工廠污水必須先進行沉淀處理，除去某些大的懸浮物及膠體等污物，然后送入曝氣池塘（這是活性污泥的活動中心）。在這里，污泥中所含有機物將被微生物大量吸附和氧化，得到凈化。經生物凈化的污水又被送入第二個沉淀池（又叫次級沉淀池）作進一步沉淀處理，除去污泥。沉淀的污水直接排入水域之中，這樣，就完成了一個處理程序。
為提高凈化效率、縮短凈化周期，可采用活性污泥回流的方法，即把次級沉淀池的活性污泥水打入再生池再生，然后送曝氣池塘使用。用好氧生物法處理廢水有投資少、運行費用低、操作簡單等優點，因而得到廣泛應用，但如果不具備氧氣、營養物等條件不能采用。
二、食品工廠設計之污水處理的厭氧生物處理法
在密閉無氧的條件下，有機物如糞便、污泥、廚房垃圾等通過厭氧性微生物及其代謝酶的作用被分解，除去臭味，致使病原菌和寄生蟲卵被殺滅，利用這種途徑處理廢水的方法稱作厭氧生物處理法，也稱厭氧消化。厭氧微生物有產酸菌和甲烷菌。產酸菌能將糖類、脂肪、蛋白質等有機物變為低級脂肪酸、醇和酮，甲烷菌進一步把它們轉變為甲烷和二氧化碳。為了保證厭氧消化的正常進行，必須將溫度、pH及氧化還原電勢維持在一定范圍內，以保證微生物的正常活動。有機物經厭氧消化后生成的殘渣可作農田肥料，產生的氣體是有價值的能源。農村的沼氣池是厭氧生物法應用的典型實例。在工業上應用厭氧生物處理肉類加工廠、制糖廠、罐頭廠的廢水，均獲得良好的效果。
